Dans le détail :

La qualité relativement dégradée de l’eau en début de semaine s’explique par des précipitations importantes et un débit qui repart à la hausse en fin de semaine. Le débit est ainsi près de six fois supérieur au débit habituel de la Seine en été. Par ailleurs, l’ensoleillement reste inférieur aux normes de saison.
La hausse du taux d’E. coli les 18, 19 et 20 juin s’explique par les pluies des jours précédents et une qualité dégradée de la Seine en amont de Paris. En effet, le ColiMinder, appareil de mesure en continu qui permet de détecter une pollution, installé en amont de Paris, sur la rive gauche, observe des pics de pollution périodiques correspondant à des déversements qui proviennent de la Seine en amont.
Les pluies des 17 et 18 juin ont permis un premier remplissage en conditions réelles du bassin d’Austerlitz. Le bassin a été rempli à 80 % et a permis d’éviter de déverser 40 000 m³ d’eaux usées et eaux de pluie dans la Seine. Il a ensuite été vidangé en 24 heures.
Comme tout organisme vivant, les bactéries ont une décroissance naturelle (elles meurent). Cette décroissance est accélérée par le soleil, la chaleur et un débit estival (entre 100 m³/s et 150 m³/s). Le très fort débit de la Seine ainsi que le contexte hydrologique défavorable ralentissent nettement le processus naturel de décroissance des bactéries.
On observe toujours des écarts significatifs entre les résultats d’analyses des échantillons prélevés sur les sites Bercy, Pont Marie et Alexandre-III avec ceux du site Pont de Grenelle. Ils sont dus au débit encore très élevé du fleuve qui ne permet pas le mélange fonctionnel des eaux de la Marne et des eaux de la Seine. La rive gauche est représentative de la qualité de l’eau de la Seine tandis que la rive droite est représentative de la qualité de l’eau de la Marne. Le prélèvement réalisé sur le site de Grenelle se situe en rive gauche, ce qui explique le fait que la qualité de l’eau sur ce site soit parfois moins bonne que celle sur les trois autres points (situés sur la rive droite).